Alguns livros do Arquivo Provincial Franciscano sofreram um desgaste por manuseio que pode ocasionar orelhas, dobras, ranhuras, rasgos e dificuldade ao fechar. Algumas obras estão passando por um processo de reestruturação de suas lombadas utilizando tecidos com um tratamento especial, e/ou papel estão sendo utilizados também nos revestimentos as partes danificadas da capa.